近日,西南大学园艺园林学院与山东极智生物科技有限公司联合研发,成功推出首款芥菜6K液相育种芯片——“芥芯一号”。
团队骨干魏大勇老师等基于16个芥菜变种的基因组资源和重要性状信息,经过系统筛选,设计了6300个高质量标记位点,兼顾标记的代表性、多态性和基因组分布均匀性。其中,包括14个关键功能位点、334个变种特异前景位点、90个性状关联位点、422个GWAS关联位点,以及高多态性和高LD背景选择位点等,可覆盖抗病、品质、农艺性状及遗传背景等多个育种需求。

“芥芯一号”可广泛应用于芥菜种质资源鉴定、遗传多样性分析、QTL定位、GWAS分析、核心基因单倍型解析以及分子标记辅助选择等,为芥菜精准育种提供高效的分子工具。同时,芯片还可用于基因编辑、基因干扰和超表达等生物技术材料的遗传鉴定。
相比传统固定式芯片,液相育种芯片具有标记组合灵活、检测效率高、适用范围广、便于持续升级等优势,可根据不同育种目标灵活组合和扩展标记,满足芥菜种质资源评价和分子育种的多样化需求。
“芥芯一号”的成功开发,实现了从种质资源鉴定、遗传解析到分子选择育种的有效衔接,为芥菜优异种质资源挖掘和精准育种提供了新的技术支撑,对推动芥菜种业创新和产业高质量发展具有积极意义。
初审:魏大勇、汤青林
复审:许淑雅、张靖悦
终审:郭启高