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枇杷团队在枇杷高质量基因组和种质资源重测序方面取得新进展

来源: 日期:2023-02-15点击:


近日,学院枇杷团队的野生枇杷高质量基因组和种质资源重测序研究成果,发表在园艺学国际顶刊、中国科技期刊卓越行动计划领军期刊《Horticulture Research》。该研究为枇杷基因组进化、种质资源多样性和果实驯化提供了新见解。

枇杷团队在30多年的枇杷种质资源收集、创制和评价基础上,构建了世界上首个染色体级别的野生枇杷基因组,并对枇杷种质资源进行了重测序分析。比较基因组分析表明,枇杷基因组在经历了双子叶植物共有的基因组复制事件后,又经历了一次近期的全基因组复制事件,导致枇杷、苹果和梨发生分化。枇杷扩张的基因家族主要涉及花粉识别、分生组织发育、免疫反应、DNA代谢调控等过程,进而提高了枇杷对环境的适应性。

野生和栽培种质资源的重测序表明,野生枇杷比栽培枇杷品种的杂合度高,具有更高的遗传多样性。在枇杷驯化过程中,与果实风味、大小、颜色相关的糖类、有机酸、氨基酸、类黄酮、类胡萝卜素等生物合成和代谢途径基因受到了选择。进一步,枇杷黄肉和白肉果实发育过程的转录组和代谢组关联分析发现,关键差异基因和代谢物主要涉及糖代谢、植物激素信号转导、类黄酮和类胡萝卜素生物合成。

    论文链接:https://doi.org/10.1093/hr/uhac265。